Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nlrp6Q91WS2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Nlrp6Q91WS2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nlrp6Q91WS2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nlrp6Q91WS2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nlrp6Q91WS2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nlrp6Q91WS2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nlrp6Q91WS2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms