Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnot6lQ8VEG6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Cnot6lQ8VEG6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnot6lQ8VEG6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnot6lQ8VEG6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cnot6lQ8VEG6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot6lQ8VEG6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot6lQ8VEG6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot6lQ8VEG6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms