Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3il1Q8VDV3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3il1Q8VDV3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3il1Q8VDV3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3il1Q8VDV3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3il1Q8VDV3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3il1Q8VDV3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3il1Q8VDV3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3il1Q8VDV3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3il1Q8VDV3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3il1Q8VDV3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3il1Q8VDV3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3il1Q8VDV3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3il1Q8VDV3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3il1Q8VDV3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab3il1Q8VDV3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms