Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy2Q8R4C2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy2Q8R4C2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rufy2Q8R4C2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy2Q8R4C2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms