Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gga1Q8R0H9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gga1Q8R0H9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gga1Q8R0H9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms