Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sumf1Q8R0F3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sumf1Q8R0F3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sumf1Q8R0F3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sumf1Q8R0F3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 430.9 ms