Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc12Q8K5B8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc12Q8K5B8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms