Protein–RNA interactions for Protein: Q8K561

Otoa, Otoancorin, mousemouse

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtoaQ8K561 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
OtoaQ8K561 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OtoaQ8K561 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OtoaQ8K561 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OtoaQ8K561 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms