Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxn4Q8K3Q3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn4Q8K3Q3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms