Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r188Q8K3N2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r188Q8K3N2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms