Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Paf1Q8K2T8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Paf1Q8K2T8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms