Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H7

Slc45a3, Solute carrier family 45 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a3Q8K0H7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc45a3Q8K0H7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc45a3Q8K0H7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc45a3Q8K0H7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms