Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lmbrd1Q8K0B2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmbrd1Q8K0B2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmbrd1Q8K0B2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms