Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX6

Clec4a3, C-type lectin domain family 4, member a3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a3Q8JZX6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clec4a3Q8JZX6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clec4a3Q8JZX6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4a3Q8JZX6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms