Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TwnkQ8CIW5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TwnkQ8CIW5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms