Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rab11fip3Q8CHD8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rab11fip3Q8CHD8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rab11fip3Q8CHD8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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