Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2bQ8CFI7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr2bQ8CFI7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2bQ8CFI7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms