Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEF1

Fem1c, Protein fem-1 homolog C, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fem1cQ8CEF1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fem1cQ8CEF1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fem1cQ8CEF1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fem1cQ8CEF1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fem1cQ8CEF1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms