Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc63Q8CDV6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms