Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atad2Q8CDM1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atad2Q8CDM1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atad2Q8CDM1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms