Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm16223Q8CBM3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm16223Q8CBM3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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