Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim47Q8C0E3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim47Q8C0E3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim47Q8C0E3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms