Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdf3Q8BYK6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdf3Q8BYK6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdf3Q8BYK6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdf3Q8BYK6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdf3Q8BYK6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdf3Q8BYK6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdf3Q8BYK6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdf3Q8BYK6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdf3Q8BYK6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdf3Q8BYK6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdf3Q8BYK6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdf3Q8BYK6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdf3Q8BYK6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms