Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX90

Fndc3a, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3aQ8BX90 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3aQ8BX90 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3aQ8BX90 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3aQ8BX90 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3aQ8BX90 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3aQ8BX90 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3aQ8BX90 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc3aQ8BX90 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc3aQ8BX90 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms