Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pggt1bQ8BUY9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pggt1bQ8BUY9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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