Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp43Q8BUM9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp43Q8BUM9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp43Q8BUM9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms