Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp1Q8BJQ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp1Q8BJQ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms