Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX0

4933402J07Rik, RIKEN cDNA 4933402J07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402J07RikQ8BHX0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933402J07RikQ8BHX0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402J07RikQ8BHX0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
4933402J07RikQ8BHX0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms