Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf41Q8BH75 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf41Q8BH75 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf41Q8BH75 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf41Q8BH75 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf41Q8BH75 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf41Q8BH75 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf41Q8BH75 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rnf41Q8BH75 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rnf41Q8BH75 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rnf41Q8BH75 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms