Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Katnb1Q8BG40 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Katnb1Q8BG40 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Katnb1Q8BG40 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms