Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zbed4Q80WQ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zbed4Q80WQ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed4Q80WQ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms