Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Otop3Q80UF9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otop3Q80UF9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Otop3Q80UF9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms