Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccp110Q7TSH4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccp110Q7TSH4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ccp110Q7TSH4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccp110Q7TSH4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccp110Q7TSH4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms