Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf516Q7TSH3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf516Q7TSH3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf516Q7TSH3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms