Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PhkbQ7TSH2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PhkbQ7TSH2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PhkbQ7TSH2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PhkbQ7TSH2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PhkbQ7TSH2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms