Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Raver2Q7TPD6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Raver2Q7TPD6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Raver2Q7TPD6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Raver2Q7TPD6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms