Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl2Q78Y63 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdcl2Q78Y63 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcl2Q78Y63 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms