Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17,94■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,93■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17,93■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17,93■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17,93■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17,93■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,91■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17,91■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17,9■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17,89■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17,88■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,88■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,88■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17,86■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,86■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17,86■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17,86■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,85■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17,85■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,85■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17,84■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,84■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17,84■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,83■□□□□ 0,45
Vma21Q78T54 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Vma21Q78T54 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Vma21Q78T54 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Vma21Q78T54 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Vma21Q78T54 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Vma21Q78T54 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Vma21Q78T54 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Vma21Q78T54 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Vma21Q78T54 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17,82■□□□□ 0,44
Vma21Q78T54 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Vma21Q78T54 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17,82■□□□□ 0,44
Vma21Q78T54 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Vma21Q78T54 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,7 ms