Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sys1Q78S06 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sys1Q78S06 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms