Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chsy1Q6ZQ11 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chsy1Q6ZQ11 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
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