Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smpd4Q6ZPR5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms