Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssxb3Q6XAS4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssxb3Q6XAS4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssxb3Q6XAS4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssxb3Q6XAS4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssxb3Q6XAS4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssxb3Q6XAS4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssxb3Q6XAS4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssxb3Q6XAS4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssxb3Q6XAS4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssxb3Q6XAS4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssxb3Q6XAS4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssxb3Q6XAS4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms