Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NfrkbQ6PIJ4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NfrkbQ6PIJ4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms