Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms