Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtifQ6PEE2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CtifQ6PEE2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CtifQ6PEE2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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