Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.9 ms