Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cachd1Q6PDJ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cachd1Q6PDJ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cachd1Q6PDJ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cachd1Q6PDJ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms