Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Herc4Q6PAV2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Herc4Q6PAV2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Herc4Q6PAV2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Herc4Q6PAV2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Herc4Q6PAV2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Herc4Q6PAV2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Herc4Q6PAV2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Herc4Q6PAV2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Herc4Q6PAV2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Herc4Q6PAV2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Herc4Q6PAV2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Herc4Q6PAV2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Herc4Q6PAV2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Herc4Q6PAV2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Herc4Q6PAV2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms