Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nwd2Q6P5U7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Nwd2Q6P5U7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Nwd2Q6P5U7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nwd2Q6P5U7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nwd2Q6P5U7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nwd2Q6P5U7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nwd2Q6P5U7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nwd2Q6P5U7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nwd2Q6P5U7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nwd2Q6P5U7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Nwd2Q6P5U7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nwd2Q6P5U7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nwd2Q6P5U7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nwd2Q6P5U7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nwd2Q6P5U7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Nwd2Q6P5U7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nwd2Q6P5U7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Nwd2Q6P5U7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nwd2Q6P5U7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nwd2Q6P5U7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nwd2Q6P5U7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nwd2Q6P5U7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms