Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam222bQ6P539 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam222bQ6P539 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam222bQ6P539 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms