Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZH9

Rasgrp3, RAS, guanyl-releasing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp3Q6NZH9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgrp3Q6NZH9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasgrp3Q6NZH9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasgrp3Q6NZH9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rasgrp3Q6NZH9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasgrp3Q6NZH9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasgrp3Q6NZH9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasgrp3Q6NZH9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasgrp3Q6NZH9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasgrp3Q6NZH9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasgrp3Q6NZH9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasgrp3Q6NZH9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasgrp3Q6NZH9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasgrp3Q6NZH9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasgrp3Q6NZH9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasgrp3Q6NZH9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms