Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q6DFW0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q6DFW0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q6DFW0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q6DFW0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q6DFW0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q6DFW0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q6DFW0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6DFW0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q6DFW0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q6DFW0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6DFW0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q6DFW0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q6DFW0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6DFW0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q6DFW0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6DFW0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6DFW0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6DFW0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q6DFW0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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